En el bombo estuvieron los dos primeros clasificados de cada uno de los ocho grupos.
En el primer bombo se introdujeron los ocho subcampeones; C.D. Géminis, C.D. Puertorrealeña, Chiclana Industrial C.F., C.D. Rota, A.D. Los Cortijillos, C.F. San José Obrero, C.D. Guadalcacín y Algeciras C.F., que actuaran como locales en la primera eliminatoria.
En el segundo de los bombos se encuadraron los ocho campeones; Cádiz C.F., C.D. La Salle Puerto Real, Sporting Conil, Chipiona C.F., Peña Madridista Linense, U.D. Villamartín, Xerez C.D., C.D. Juan Sebastian Elcano, que actuaran como visitantes en la primera eliminatoria.
Las bolas se fueron extrayendo de una en una, empezando por el bombo de los subcampeones, una vez extraídas las ocho bolas, se empezó a sacar las del bombo de los campeones, quedando emparejados en el mismo orden de salida con los extraídos del bombo primero.
No podrán coincidir en la primera eliminatoria aquellos equipos que hubiesen participado en el mismo grupo en la fase regular.
Las fechas fijadas para la primera eliminatoria fueron; Ida: 18 de Mayo de 2013 y la Vuelta 25 de Mayo de 2013.
Los vencedores de esta primera eliminatoria se enfrentarán a doble partido en una segunda eliminatoria a disputar los días; Ida: 1 de Junio de 2013 y la Vuelta 8 de Junio de 2013.
Ascenderán a Preferente Alevín los cuatros vencedores de la segunda eliminatoria.
Una vez efectuado el sorteo, el mismo dio el siguiente resultado:
Nota Informativa
En el supuesto de que hubiese una vacante de entre los 16 clubes que componen el grupo de Preferente Alevín para la Temporada 2013/14, esta sería ocupada por el club con mejor coeficiente (En Ligar Regular), de entre los perdedores de la última eliminatoria de la Fase de Ascenso.
En el supuesto de que hubiese dos vacantes, la primera sería ocupada por lo expuesto anteriormente y la segunda la ocuparía el club clasificado en el puesto 13º de la categoría Preferente Alevín Temporada 2012/13.
